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    機器學習識別具有傳播 SARS-CoV-2 潛力的哺乳動物物種

    摘要 SARS-CoV-2 在人和其他哺乳動物之間來回傳播會增加新變異的風險,并威脅到控制 的努力。今天發(fā)表在英國皇家學會會刊 B 上的一項新研

    SARS-CoV-2 在人和其他哺乳動物之間來回傳播會增加新變異的風險,并威脅到控制 的努力。今天發(fā)表在英國皇家學會會刊 B 上的一項新研究使用一種新的建模方法來預測 5,400 種哺乳動物的人畜共患病能力,將預測能力提高了一個數(shù)量級。在標記的高風險物種中,許多物種生活在人類附近和 熱點地區(qū)。

    預測高危哺乳動物物種的一個主要瓶頸是 ACE2 的有限數(shù)據(jù),ACE2 是 SARS-CoV-2 在動物體內(nèi)結(jié)合的細胞受體。ACE2 允許 SARS-CoV-2 進入宿主細胞,并且存在于所有主要脊椎動物群中。很可能所有脊椎動物都具有 ACE2 受體,但序列僅適用于 326 個物種。

    為了克服這一障礙,該團隊開發(fā)了一種機器學習模型,該模型將 5,400 種哺乳動物的生物特征數(shù)據(jù)與 ACE2 的可用數(shù)據(jù)相結(jié)合。目標:確定具有高“人畜共患病能力”的哺乳動物物種——能夠感染 SARS-CoV-2 并將其傳播給其他動物和人。他們開發(fā)的方法可以幫助擴展對 以外的疾病系統(tǒng)的預測能力。

    共同主要作者、卡里生態(tài)系統(tǒng)研究所的博士后助理 Ilya Fischhoff 評論說:“SARS-CoV-2 是導致 的病毒,它起源于動物,然后傳播給人類?,F(xiàn)在,人們已經(jīng)在各種哺乳動物中引起了回溢感染,包括飼養(yǎng)在農(nóng)場、動物園甚至我們家中的哺乳動物。了解哪些哺乳動物能夠重新感染我們對于防止溢出感染和危險的新變異至關重要。”

    當病毒從人傳給動物再傳給人時,稱為二次外溢。這種現(xiàn)象可以加速在人類中建立新的變異,這些變異的毒性更強,對疫苗的反應更小。已經(jīng)在丹麥和荷蘭的養(yǎng)殖水貂中報告了 SARS-CoV-2 的二次外溢,這導致了至少一種新的 SARS-CoV-2 變種。

    資深作者和卡里研究所疾病生態(tài)學家 Barbara Han 說:“二次溢出允許在新宿主中建立的 SARS-CoV-2 將潛在的更具傳染性的毒株傳播給人類。識別可有效傳播 SARS-CoV-2 的哺乳動物物種是指導監(jiān)測和防止病毒在人和其他動物之間持續(xù)傳播的重要一步,從而使疾病控制更加昂貴和困難。”

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